¿Hablamos de drones de carreras? Si tienes FlySky lo que te pasa es normal. De hecho, todos mis racer están configurados en el mismo modelo de la emisora. Lógicamente, sólo enciendo uno de los drones cada vez, al menos hasta que sea una máquina o me crezcan un par de ojos nuevos.
Técnicamente no usan el mismo canal. El bind lo que hace es configurar el identificador de tu emisora en el receptor del dron. Como los dos drones han almacenado el mismo identificador (cada emisora tiene sólo uno) detectan tu emisora y y le responden. Pero sólo a ella, no a cualquier otra.
Si quieres "separarlos", puedes asignar un modelo a cada dron. Volverán a funcionar los dos si los enciendes a la vez, pero podrás configurar características por separado (rates, switchs, etc).
Pero si quieres mi consejo, si son todos racer, configura los drones igual (mismos canales para todo) y te ahorras andar tocando la emisora con cada dron.